Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGM3Q08188 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms