Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN3Q08043 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms