Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL16A1Q07092 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL16A1Q07092 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms