Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX4Q06945 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX4Q06945 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX4Q06945 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX4Q06945 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX4Q06945 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX4Q06945 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms