Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEUP1Q05D60 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms