Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDSPL2Q05D32 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms