Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RELQ04864 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RELQ04864 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RELQ04864 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RELQ04864 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RELQ04864 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RELQ04864 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RELQ04864 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RELQ04864 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RELQ04864 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RELQ04864 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RELQ04864 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RELQ04864 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RELQ04864 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RELQ04864 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RELQ04864 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RELQ04864 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RELQ04864 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RELQ04864 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RELQ04864 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RELQ04864 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RELQ04864 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RELQ04864 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RELQ04864 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELQ04864 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELQ04864 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELQ04864 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELQ04864 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELQ04864 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELQ04864 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RELQ04864 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELQ04864 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELQ04864 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELQ04864 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELQ04864 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RELQ04864 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 550.7 ms