Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TLE4Q04727 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TLE4Q04727 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms