Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID5AQ03989 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms