Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPCQ03188 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPCQ03188 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms