Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG1Q02413 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms