Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFRSF17Q02223 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms