Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms