Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms