Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDM2Q00987 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM2Q00987 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms