Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDK16Q00536 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms