Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA4Q00056 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA4Q00056 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms