Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2C1P98194 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms