Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELF3P78545 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELF3P78545 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELF3P78545 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELF3P78545 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELF3P78545 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELF3P78545 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELF3P78545 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELF3P78545 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELF3P78545 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELF3P78545 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELF3P78545 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ELF3P78545 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ELF3P78545 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELF3P78545 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELF3P78545 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELF3P78545 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELF3P78545 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELF3P78545 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELF3P78545 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELF3P78545 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELF3P78545 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms