Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNA1P78396 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms