Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UFM1P61960 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UFM1P61960 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UFM1P61960 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UFM1P61960 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UFM1P61960 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UFM1P61960 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UFM1P61960 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UFM1P61960 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UFM1P61960 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UFM1P61960 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UFM1P61960 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UFM1P61960 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UFM1P61960 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UFM1P61960 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFM1P61960 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFM1P61960 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UFM1P61960 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UFM1P61960 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UFM1P61960 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFM1P61960 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFM1P61960 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFM1P61960 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UFM1P61960 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms