Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VBP1P61758 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VBP1P61758 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VBP1P61758 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VBP1P61758 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VBP1P61758 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VBP1P61758 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VBP1P61758 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VBP1P61758 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms