Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP12P59046 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP12P59046 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms