Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms