Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP107P57740 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP107P57740 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP107P57740 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP107P57740 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP107P57740 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP107P57740 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP107P57740 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms