Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RIPK4P57078 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIPK4P57078 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms