Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAG2P55895 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAG2P55895 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAG2P55895 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAG2P55895 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAG2P55895 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAG2P55895 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAG2P55895 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAG2P55895 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAG2P55895 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAG2P55895 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAG2P55895 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAG2P55895 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAG2P55895 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAG2P55895 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAG2P55895 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAG2P55895 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAG2P55895 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAG2P55895 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAG2P55895 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAG2P55895 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAG2P55895 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAG2P55895 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAG2P55895 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAG2P55895 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAG2P55895 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAG2P55895 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAG2P55895 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAG2P55895 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAG2P55895 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms