Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX9P55771 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PAX9P55771 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PAX9P55771 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PAX9P55771 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PAX9P55771 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX9P55771 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX9P55771 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX9P55771 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX9P55771 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms