Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAP1L1P55209 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms