Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLTPP55058 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLTPP55058 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLTPP55058 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLTPP55058 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLTPP55058 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLTPP55058 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLTPP55058 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLTPP55058 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLTPP55058 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PLTPP55058 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLTPP55058 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLTPP55058 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLTPP55058 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLTPP55058 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLTPP55058 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLTPP55058 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLTPP55058 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLTPP55058 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLTPP55058 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLTPP55058 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLTPP55058 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLTPP55058 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLTPP55058 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLTPP55058 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms