Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMP1P54849 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMP1P54849 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMP1P54849 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMP1P54849 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EMP1P54849 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms