Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD23BP54727 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms