Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRE11P49959 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRE11P49959 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRE11P49959 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRE11P49959 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRE11P49959 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRE11P49959 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRE11P49959 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRE11P49959 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRE11P49959 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MRE11P49959 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRE11P49959 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRE11P49959 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRE11P49959 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRE11P49959 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRE11P49959 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRE11P49959 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRE11P49959 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRE11P49959 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRE11P49959 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRE11P49959 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRE11P49959 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRE11P49959 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRE11P49959 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRE11P49959 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRE11P49959 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRE11P49959 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRE11P49959 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRE11P49959 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRE11P49959 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRE11P49959 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRE11P49959 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRE11P49959 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRE11P49959 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms