Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES1P49788 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms