Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI2P48788 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms