Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT6CP48668 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT6CP48668 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms