Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC1P48547 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms