Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSSP48449 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSSP48449 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LSSP48449 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSSP48449 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSSP48449 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSSP48449 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSSP48449 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSSP48449 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSSP48449 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSSP48449 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSSP48449 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSSP48449 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSSP48449 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSSP48449 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSSP48449 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSSP48449 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSSP48449 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSSP48449 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms