Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTRNP46939 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTRNP46939 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UTRNP46939 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UTRNP46939 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UTRNP46939 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UTRNP46939 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UTRNP46939 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UTRNP46939 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UTRNP46939 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UTRNP46939 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UTRNP46939 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UTRNP46939 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UTRNP46939 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UTRNP46939 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UTRNP46939 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UTRNP46939 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UTRNP46939 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UTRNP46939 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UTRNP46939 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UTRNP46939 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UTRNP46939 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UTRNP46939 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UTRNP46939 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UTRNP46939 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UTRNP46939 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UTRNP46939 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UTRNP46939 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UTRNP46939 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UTRNP46939 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UTRNP46939 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UTRNP46939 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UTRNP46939 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UTRNP46939 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UTRNP46939 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UTRNP46939 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UTRNP46939 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UTRNP46939 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UTRNP46939 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTRNP46939 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTRNP46939 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTRNP46939 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTRNP46939 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTRNP46939 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTRNP46939 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTRNP46939 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTRNP46939 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTRNP46939 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTRNP46939 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTRNP46939 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTRNP46939 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTRNP46939 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTRNP46939 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTRNP46939 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UTRNP46939 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UTRNP46939 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UTRNP46939 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UTRNP46939 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UTRNP46939 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UTRNP46939 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UTRNP46939 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
UTRNP46939 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UTRNP46939 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UTRNP46939 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UTRNP46939 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
UTRNP46939 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UTRNP46939 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UTRNP46939 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UTRNP46939 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UTRNP46939 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UTRNP46939 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UTRNP46939 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UTRNP46939 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UTRNP46939 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UTRNP46939 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UTRNP46939 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UTRNP46939 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UTRNP46939 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UTRNP46939 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UTRNP46939 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
UTRNP46939 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UTRNP46939 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UTRNP46939 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UTRNP46939 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms