Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA1P43355 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms