Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP2P42575 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP2P42575 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP2P42575 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP2P42575 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP2P42575 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP2P42575 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP2P42575 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP2P42575 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP2P42575 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP2P42575 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP2P42575 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP2P42575 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP2P42575 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP2P42575 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP2P42575 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP2P42575 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP2P42575 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP2P42575 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP2P42575 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP2P42575 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP2P42575 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP2P42575 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP2P42575 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms