Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB10P40306 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB10P40306 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms