Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 NCB2YDR397C 441 nt3.53□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YGL159WYGL159W 1113 nt3.53□□□□□ -1.84
VFA1P40080 SCEIQ0160 708 nt3.53□□□□□ -1.84
VFA1P40080 PCL5YHR071W 690 nt3.53□□□□□ -1.84
VFA1P40080 RNH203YLR154C 333 nt3.53□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YNL122CYNL122C 348 nt3.53□□□□□ -1.84
VFA1P40080 ATX1YNL259C 222 nt3.53□□□□□ -1.84
VFA1P40080 TOA1YOR194C 861 nt3.53□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YPL107WYPL107W 747 nt3.53□□□□□ -1.84
VFA1P40080 SEC66YBR171W 621 nt3.53□□□□□ -1.84
VFA1P40080 TAF6YGL112C 1551 nt3.53□□□□□ -1.84
VFA1P40080 ERG11YHR007C 1593 nt3.53□□□□□ -1.84
VFA1P40080 AFR1YDR085C 1863 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 ATG26YLR189C 3597 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 RPS13YDR064W 456 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 MIG3YER028C 1185 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 TDA2YER071C 381 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YGR228WYGR228W 345 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YIL029CYIL029C 429 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 BET4YJL031C 984 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 IMP4YNL075W 873 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 SWS2YNL081C 432 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 SIZ1YDR409W 2715 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 POL4YCR014C 1749 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 ERB1YMR049C 2424 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 VAC14YLR386W 2643 nt3.52□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YNR063WYNR063W 1824 nt3.51□□□□□ -1.85
VFA1P40080 PCI8YIL071C 1335 nt3.51□□□□□ -1.85
VFA1P40080 HMRA1YCR097W 381 nt3.51□□□□□ -1.85
VFA1P40080 MXR1YER042W 555 nt3.51□□□□□ -1.85
VFA1P40080 TIM10YHR005C-A 282 nt3.51□□□□□ -1.85
VFA1P40080 UBX4YMR067C 1251 nt3.51□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YNL089CYNL089C 477 nt3.51□□□□□ -1.85
VFA1P40080 MPD2YOL088C 834 nt3.51□□□□□ -1.85
VFA1P40080 AFT2YPL202C 1251 nt3.51□□□□□ -1.85
VFA1P40080 MET10YFR030W 3108 nt3.51□□□□□ -1.85
VFA1P40080 DNM1YLL001W 2274 nt3.51□□□□□ -1.85
VFA1P40080 MCD4YKL165C 2760 nt3.51□□□□□ -1.85
VFA1P40080 NSA1YGL111W 1392 nt3.51□□□□□ -1.85
VFA1P40080 AVT5YBL089W 1380 nt3.51□□□□□ -1.85
VFA1P40080 LCB5YLR260W 2064 nt3.5□□□□□ -1.85
VFA1P40080 FMN1YDR236C 657 nt3.5□□□□□ -1.85
VFA1P40080 SMX2YFL017W-A 234 nt3.5□□□□□ -1.85
VFA1P40080 FMP32YFL046W 624 nt3.5□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YGR039WYGR039W 312 nt3.5□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt3.5□□□□□ -1.85
VFA1P40080 EAF6YJR082C 342 nt3.5□□□□□ -1.85
VFA1P40080 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt3.5□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YPS6YIR039C 1614 nt3.5□□□□□ -1.85
VFA1P40080 CPA2YJR109C 3357 nt3.5□□□□□ -1.85
VFA1P40080 DRS2YAL026C 4068 nt3.5□□□□□ -1.85
VFA1P40080 CDC40YDR364C 1368 nt3.5□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YMR317WYMR317W 3423 nt3.5□□□□□ -1.85
VFA1P40080 BAR1YIL015W 1764 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YDR115WYDR115W 318 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YDR149CYDR149C 708 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 SMT3YDR510W 306 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YGR073CYGR073C 372 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 RPL11BYGR085C 525 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 CIC1YHR052W 1131 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 RPF1YHR088W 888 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 ACF4YJR083C 930 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YJR157WYJR157W 363 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YLR257WYLR257W 966 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YNL150WYNL150W 408 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 RPL11AYPR102C 525 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 FLO10YKR102W 3510 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 HRD1YOL013C 1656 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 STU1YBL034C 4542 nt3.49□□□□□ -1.85
VFA1P40080 STI1YOR027W 1770 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 MUB1YMR100W 1863 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 FKH2YNL068C 2589 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 RNT1YMR239C 1416 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YDR199WYDR199W 366 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 GLC3YEL011W 2115 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YER175W-AYER175W-A 165 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YFR054CYFR054C 579 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 RPL1BYGL135W 654 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YGR045CYGR045C 363 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 MVB12YGR206W 306 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 HHF1YBR009C 312 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 RPL1AYPL220W 654 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YRM1YOR172W 2361 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 SPR3YGR059W 1539 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 CIN8YEL061C 3003 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 TGL3YMR313C 1929 nt3.48□□□□□ -1.85
VFA1P40080 RSF2YJR127C 4143 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 GSC2YGR032W 5688 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 RPN3YER021W 1572 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 PEX5YDR244W 1839 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 SHS1YDL225W 1656 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 MIC19YFR011C 513 nt3.47□□□□□ -1.85
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