Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK1P39086 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms