Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF4A3P38919 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms