Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms