Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL9P32969 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL9P32969 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL9P32969 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL9P32969 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL9P32969 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL9P32969 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL9P32969 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL9P32969 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL9P32969 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL9P32969 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL9P32969 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL9P32969 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL9P32969 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL9P32969 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL9P32969 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL9P32969 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL9P32969 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL9P32969 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL9P32969 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL9P32969 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL9P32969 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL9P32969 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL9P32969 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL9P32969 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL9P32969 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL9P32969 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL9P32969 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL9P32969 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL9P32969 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL9P32969 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL9P32969 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL9P32969 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL9P32969 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL9P32969 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL9P32969 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL9P32969 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL9P32969 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL9P32969 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL9P32969 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL9P32969 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL9P32969 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL9P32969 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL9P32969 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL9P32969 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL9P32969 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL9P32969 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL9P32969 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL9P32969 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL9P32969 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL9P32969 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL9P32969 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL9P32969 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL9P32969 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL9P32969 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL9P32969 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL9P32969 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL9P32969 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL9P32969 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL9P32969 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL9P32969 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL9P32969 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL9P32969 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL9P32969 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL9P32969 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL9P32969 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms