Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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CASQ1P31415 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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