Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms