Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRB3P28472 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRB3P28472 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms